Doanh Nghiệp Bị Tổn Thất Do Bão Có Được Khấu Trừ Thuế GTGT2025 không?

Thiên tai, bão lũ gây ra những tổn thất nặng nề về tài sản, hàng hóa cho doanh nghiệp. Trong bối cảnh đó, việc nắm rõ các quy định về khấu trừ thuế GTGT đối với hàng hóa tổn thất là vô cùng quan trọng, giúp doanh nghiệp giảm bớt gánh nặng tài chính. Bài viết này, Smarttax sẽ hướng dẫn chi tiết theo Công văn 4328/CT-CS năm 2025 của Cục thuế, căn cứ vào Luật Thuế GTGT 2024 và Nghị định 181/2025/NĐ-CP.

1. Quy Định Về Khấu Trừ Thuế GTGT Khi Hàng Hóa Bị Tổn Thất Do Bão

Dựa trên hướng dẫn chính thức từ Công văn 4328/CT-CS năm 2025 của Cục Thuế, doanh nghiệp hoàn toàn có cơ sở để khấu trừ thuế GTGT đối với hàng hóa, tài sản bị tổn thất do thiên tai (bão, lũ).

1.1. Căn Cứ Pháp Lý

Công văn 4328/CT-CS viện dẫn hai quy định pháp lý sau:

• Khoản 1 Điều 14 Luật Thuế giá trị gia tăng 2024

• Khoản 1 Điều 23 Nghị định 181/2025/NĐ-CP

Nội dung chính xác được trích dẫn như sau:

“1. Thuế giá trị gia tăng đầu vào của hàng hóa, dịch vụ sử dụng cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế giá trị gia tăng được khấu trừ toàn bộ kể cả thuế giá trị gia tăng đầu vào không được bồi thường của hàng hóa, dịch vụ chịu thuế giá trị gia tăng bị tổn thất, hàng hóa bị hao hụt tự nhiên do tính chất lý hóa trong quá trình vận chuyển. Cơ sở kinh doanh phải có đầy đủ hồ sơ, tài liệu chứng minh các trường hợp tổn thất không được bồi thường để khấu trừ thuế.”

1.2. Điều Kiện Và Giải Thích Quy Định Cho Doanh Nghiệp

Từ quy định trên, có thể rút ra những kết luận và điều kiện cụ thể để doanh nghiệp áp dụng:

• Đối Tượng Áp Dụng: Doanh nghiệp, tổ chức kinh tế nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ.

• Trường Hợp Được Khấu Trừ:

  • Thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ bị tổn thất do bão, lũ.

  • Khoản tổn thất này không được bồi thường từ bất kỳ nguồn nào (ví dụ: công ty bảo hiểm, đối tác…).

• Phạm Vi Khấu Trừ: Doanh nghiệp được khấu trừ toàn bộ số thuế GTGT đầu vào không được bồi thường nói trên.

• Điều Kiện Bắt Buộc (Yếu tố then chốt):

Doanh nghiệp phải có đầy đủ hồ sơ, tài liệu để chứng minh:
(1) Tổn thất là có thực.
(2) Tổn thất do nguyên nhân khách quan (bão, lũ).
(3) Tổn thất không được bồi thường.
Đây là cơ sở pháp lý quan trọng nhất để cơ quan thuế chấp nhận cho khấu trừ khi quyết toán thuế.

👉 Kết luận: Câu trả lời là Có. Doanh nghiệp bị tổn thất do bão được khấu trừ toàn bộ thuế GTGT đầu vào tương ứng với phần giá trị hàng hóa, dịch vụ không được bồi thường.

Lưu ý mở rộng: Quy định này cũng áp dụng tương tự cho trường hợp hàng hóa bị hao hụt tự nhiên trong định mức cho phép trong quá trình sản xuất, vận chuyển.

2. Hồ Sơ, Tài Liệu Chứng Minh Để Được Khấu Trừ Thuế

Cơ sở kinh doanh phải có đầy đủ hồ sơ, tài liệu chứng minh cho trường hợp tổn thất không được bồi thường. Đây là điều kiện tiên quyết để cơ quan thuế chấp nhận cho khấu trừ.

Các tài liệu cần thiết có thể bao gồm:

• Biên bản kiểm kê, đánh giá thiệt hại hàng hóa.

• Báo cáo giải trình về nguyên nhân, mức độ tổn thất.

• Các chứng từ chứng minh hàng hóa tổn thất không được bồi thường (Ví dụ: Văn bản từ chối bồi thường của công ty bảo hiểm, hoặc xác nhận không tham gia bảo hiểm).

• Hóa đơn GTGT đầu vào của lô hàng bị tổn thất.

• Hình ảnh, video minh chứng cho thiệt hại.

3. Quy Định Về Hàng Hóa Nhập Khẩu Ủng Hộ, Tài Trợ Khắc Phục Thiên Tai

Bên cạnh quy định về khấu trừ thuế, Nghị định 181/2025/NĐ-CP cũng quy định về chính sách miễn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu để hỗ trợ khắc phục hậu quả thiên tai.

Căn cứ điểm d khoản 15 Điều 4:

“d) Hàng hóa nhập khẩu ủng hộ, tài trợ cho phòng, chống, khắc phục hậu quả thảm họa, thiên tai, dịch bệnh, chiến tranh là hàng hóa ủng hộ, tài trợ được các bộ, cơ quan ngang bộ, Ủy ban nhân dân các tỉnh, thành phố, Ủy ban Mặt trận Tổ quốc Việt Nam các tỉnh, thành phố tiếp nhận.“

Theo đó:

• Hàng hóa nhập khẩu để ủng hộ, tài trợ cho công tác phòng, chống và khắc phục hậu quả thiên tai thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT.

• Các cơ quan tiếp nhận có thẩm quyền bao gồm: Các Bộ, cơ quan ngang Bộ; UBND cấp tỉnh; Ủy ban Mặt trận Tổ quốc Việt Nam cấp tỉnh.

• Cơ quan tiếp nhận có trách nhiệm ban hành văn bản tiếp nhận để làm căn cứ cho cơ quan hải quan áp dụng chính sách miễn thuế.

4. Kết Luận

Tóm lại, theo hướng dẫn mới nhất từ Công văn 4328/CT-CS năm 2025:

1. Doanh nghiệp bị tổn thất hàng hóa do bão, lũ được khấu trừ toàn bộ thuế GTGT đầu vào không được bồi thường.

2. Điều kiện tiên quyết là doanh nghiệp phải lập và lưu trữ đầy đủ hồ sơ, tài liệu chứng minh cho sự tổn thất này.

3. Các doanh nghiệp cần nắm rõ quy định để kịp thời thực hiện, đảm bảo quyền lợi hợp pháp của mình và giảm thiểu thiệt hại tài chính do thiên tai gây ra.